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Characterization of piemontese beef cattle using individual multilocus genotype based on DNA microsatellites

Ciampolini, Roberta and Mazzanti, Elisa and Ciani, Elena and Cetica, Valentina and Cianci, Dario (2003) Characterization of piemontese beef cattle using individual multilocus genotype based on DNA microsatellites. Annali della Facoltà di Medicina veterinaria, LVI/20 . pp. 157-170. ISSN 0365-4729

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    Abstract

    SUMMARY In the present study a sample of 47 young double-muscled bulls in a performance test, belonging to the Piemontese cattle breed, were divided into subpopulations which were homogeneous for morpho-functional traits, using three different methods. They were, moreover, characterized on a molecular level by a set of 20 microsatellite markers; genetic similarities, genetic distances, Hardy-Weinberg proportions and the coefficients for deficiency of heterozygotes were calculated within and between subpopulations. Phenotypical evaluations, both of morphological nature (somatic measurements), both related to growing traits (weight and daily gain) were available. Also eleven morpho- functional indexes were calculated between and within the aforementioned classes of measurements. The results indicate an hypothetical relationship between the Individual Multilocus Genotype and the morpho-functional type, supported by greater genetic similarities within than between subpopulations. In particular, genetic homogeneity in the group of subjects considered more distant from the meat-type was greater with respect to the subjects more evolved toward meat aptitude. An interesting genetic distance between this two extreme subpopulations was also recognizable. The coefficients for deficiency of heterozygotes indicate the presence of significantly high homozygosis at six microsatellites, particularly in subjects with greater meat aptitude. Therefore, data show convincing evidence for the existence of precise and distinct phenotypic and genotypic types, in spite of the Piemontese cattle breed’s great variability. RIASSUNTO Nel presente studio, un campione di 47 soggetti appartenenti alla razza bovina da carne Piemontese è stato suddiviso in sottopopolazioni omogenee per caratteri morfofunzionali. In aggiunta, i soggetti sono stati caratterizzati a livello molecolare mediante un set di 20 marcatori microsatellite; sono state calcolate le similarità genetiche, le distanze genetiche, le proporzioni di Hardy-Weinberg ed i coefficienti per il difetto di eterozigoti entro e tra sottopopolazioni. I risultati indicano una possibile relazione tra il Genotipo Multilocus Individuale, ottenuto mediante i marcatori microsatellite, e la tipologia morfo-funzionale, supportato da similarità genetiche entro-sottopopolazione maggiori rispetto alle similarità genetiche riscontrate tra sottopopolazioni. In particolare, l’omogeneità genetica nel gruppo dei soggetti considerati più distanti dalla tipologia-carne è risultata maggiore rispetto a quella riscontrata all’interno del gruppo dei soggetti meno orientati verso la produzione di carne; le due sottopopolazioni estreme hanno, altresì, rivelato interessanti valori di distanza genetica. I coefficienti per il difetto di eterozigoti indicano la presenza di un significativo livello di omozigosi per sei marcatori microsatellite, particolarmente in soggetti con maggior attitudine carne.

    Item Type: Article
    Uncontrolled Keywords: microsatellites, beef cattle, variability, Individual Multilocus Genotype, piemontese, variabilità, genotipo Multilocus Individuale, marcatori
    Subjects: Area07 - Scienze agrarie e veterinarie > AGR/19 - Zootecnica speciale
    Divisions: Dipartimenti (until 2012) > DIPARTIMENTO DI PRODUZIONI ANIMALI
    Depositing User: Barbara Pistoia
    Date Deposited: 13 Nov 2006
    Last Modified: 20 Dec 2010 12:16
    URI: http://eprints.adm.unipi.it/id/eprint/145

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